1.袁世凯与清政府的争夺军权

袁世凯的权势欲与清政府的皇室集权发生了十分尖锐的矛盾，这个矛盾在日益表面化。

北洋六镇的建成和两次会操，说明在中国真正指挥着军队的不是朝廷，而是袁世凯。其个人势力的迅速膨胀，自然成为满洲贵族的众矢之的。尽管他一贯注意减少清政府的猜忌，如在山东任巡抚时，他曾奏请旗籍道员荫昌“佐赞军务”；在署理直隶总督时，他也挑选了三千八旗子弟增加新军训练，并奏保旗籍道员铁良为京旗练兵翼长，参预训练新建陆军；在京畿成立督练新军处，他推举奕劻为督练大臣而自愿居其次，巧妙地利用这些人作掩护来扩充自己的势力。但现在，他也像当年的曾国藩一样，确实意识到自己的“权势”已引起了疑忌，将会遭到“中伤”，从而不利于今后的再扩张。所以，不如采取主动，在光绪三十二年十月初三日(1906年11月18日)他宣称自己所担负的职务过多，上奏请“开去各项兼差以专责成而符新制”，辞去了八大臣的兼差，作出了某种礼让姿态，清政府于初七日很快作出了反应：“着照所请，开去各项兼差。”[179]同时，他还在附片中请求将第一、第三、第五、第六镇移交给新设的陆军部。然而，他不能放弃嫡系部队，所以要求保留第二、第四两镇的指挥权。但是，由于各镇的将领都是袁的忠仆，以袁世凯为轴心的北洋势力却是无法移交的。

与清政府的统制手法一样，在北洋军阀的扩编过程中，袁世凯的猜疑心也是极重的。各镇统制经常调来调去，如段祺瑞先后担任过第三、第四、六等镇的统制，其目的是防止在他手下造成另一系统或集团势力。

光绪三十三年(1907年)三月，袁世凯的死党徐世昌授任东三省总督，奏准调第三镇和两个混成协随他赴东三省，北洋军阀势力也随之伸展至东北各省，并由此将在北洋军阀集团中增加奉系这一派系势力。